Narzędzia bioinformatyczne to nowa era w badaniach nad wirusami

Narzędzia bioinformatyczne zmieniają sposób, w jaki naukowcy badają interakcje między wirusami a ich gospodarzami. Projekt VIROINF, wspierany przez Unię Europejską, koncentruje się na integracji zaawansowanych technologii bioinformatycznych z eksperymentalnymi badaniami nad wirusami. Celem jest ulepszenie diagnostyki, terapii i strategii zapobiegania chorobom wirusowym.

„Zrozumienie interakcji wirus-gospodarz to kluczowy obszar wirusologii, w którym brakowało dotychczas odpowiednich narzędzi,” zauważa Manja Marz, koordynatorka projektu z Uniwersytetu Friedricha Schillera w Jenie.

Modelowanie interakcji wirus-gospodarz

Centralnym elementem projektu było modelowanie ewolucji wirusów oraz ich interakcji z gospodarzami. Badania łączyły podejście teoretyczne z eksperymentalnym, co pozwoliło na stworzenie nowych narzędzi do analizy danych genomicznych. Dzięki tym innowacjom naukowcy mogą lepiej zrozumieć dynamikę wirusów i przewidywać ich zachowanie.

Do najważniejszych osiągnięć projektu należą:

  • Projektowanie algorytmów uczenia maszynowego, usprawniających odzyskiwanie genomów wirusowych,
  • Opracowanie metod znakowania wirusów w środowiskach beztlenowych do identyfikacji par fag-gospodarz,
  • Stworzenie narzędzia do analizy cech białek wirusowych istotnych dla powiązań z gospodarzem.

Nowe odkrycia w ewolucji wirusów

Narzędzia opracowane w ramach VIROINF przyczyniły się do lepszego zrozumienia biologii fagów i mechanizmów infekcji wirusowych. Kluczowym odkryciem było zidentyfikowanie białek wirusowych odpowiadających za specyficzność względem gospodarza, co pozwala na głębsze poznanie relacji wirus-gospodarz. Te informacje mogą znaleźć zastosowanie w opracowywaniu bardziej precyzyjnych terapii wirusowych.

Szkolenie przyszłych ekspertów

Jednym z priorytetów projektu było szkolenie naukowców na początku kariery. Program szkoleniowy umożliwił im zdobycie specjalistycznej wiedzy w zakresie bioinformatyki i wirusologii, a także rozwinięcie praktycznych umiejętności w modelowaniu interakcji wirus-gospodarz.

„Tworzenie społeczności badawczej opartej na współpracy okazało się kluczowe dla wymiany wiedzy i rozwijania nowych pomysłów,” podkreśla Marz. Dzięki temu młodzi naukowcy są lepiej przygotowani do podejmowania wyzwań w tej dziedzinie.

Przyszłość badań nad wirusami

Projekt VIROINF otwiera nowe możliwości w wirusologii, integrując bioinformatykę z badaniami laboratoryjnymi. Dalsze etapy prac będą skupiać się na rozwijaniu narzędzi i modeli, które znajdą zastosowanie w badaniach akademickich oraz w praktyce klinicznej.

„Zintegrowane ramy łączące bioinformatykę i wirusologię eksperymentalną będą miały fundamentalne znaczenie dla przyszłych badań,” podsumowuje Marz. Oczekuje się, że wyniki projektu przyczynią się do lepszego zrozumienia ewolucji i dynamiki wirusów, a także umożliwią opracowanie bardziej skutecznych strategii diagnostycznych i terapeutycznych.

Na podstawie: https://cordis.europa.eu


opublikowano: 2025-01-09


Polityka Prywatności